Penyerang Argentina berusia 38 tahun itu mencetak dua gol di babak pertama untuk membawa Miami mengendalikan permainan, sebelum memberikan dua assist untuk Tadeo Allende setelah jeda untuk memastikan kemenangan meyakinkan.
Dengan demikian, tim asuhan Javier Mascherano memenangkan seri best-of-three dengan skor 2-1, setelah menang 3-2 di pertandingan pertama dan kalah 2-1 di pertandingan kedua.
Messi mengakhiri seri tersebut dengan lima gol dan tiga assist, yang berarti ia terlibat dalam semua delapan gol yang dicetak Miami dalam tiga pertandingan tersebut.
“Saya ingin mengucapkan selamat kepada Leo atas permainan yang ia mainkan,” kata bos Miami, Mascherano.
“Dialah orang pertama yang membimbing kami dalam tekanan tinggi. Melihatnya menekan seperti itu di usia 38 tahun sungguh luar biasa.
“Kita semua tahu tentang Leo saat menguasai bola, tetapi apa yang terjadi dengan Leo tanpa bola hari ini sungguh mengesankan.”
Miami, yang menderita kekalahan di babak pertama dalam dua dari tiga musim terakhir, akan menghadapi FC Cincinnati dalam semifinal satu kali pada akhir pekan tanggal 22 dan 23 November.
Pada pertandingan lain hari Sabtu, Minnesota United mengalahkan Seattle Sounders 7-6 melalui adu penalti setelah hasil imbang 3-3 yang mendebarkan.
Mereka akan menghadapi pemenang pertandingan hari Minggu antara Portland Trailblazers dan San Diego FC.